NGS1

tehnologija sekvenciranja

folding video

splicing video

proteasome video

Zadaci

• Zadatak 1: Sanger sekvenciranje
  • Khan academy intro, zanima nas samo dio o Sangerovom sekvenciranju
  • video 1
  • video 2
• Zadatak 2: pirosekvenciranje (Roche 454)
  • pirosekvenciranje na Wikipediji
  • kako se koristi pirofosfat u dobivanju signala
  • 454 - Pyrosequencing
• Zadatak 3: ionsko poluvodičko sekvenciranje (IonTorrent)
  • IonTorrent - ion semiconductor sequencing
  • na Wikipediji
• Zadatak 4: sekvenciranje bojom/sintezom (Illumina)
  • Illumina
  • na Wikipediji
• Zadatak 5: sekvenciranje nanoporama (Nanoporetech)
  • how nanopore sequencing works
  • na Wikipediji
  • minijaturizacija tehnologije
• Zadatak 6: usporedba metoda: cijena vs. mogucnosti
  • članak iz kojeg nas zanima samo dio "Sequencing Technologies"
• Zadatak 7: sekvenciranje genoma pojedinačnih stanica
  • single cell sequencing - danas: Single-cell genome (DNA) sequencing, posebno MDA- Wikipedia
  • video (00:30- 02:00)